Med proteiner som nycklar till SARS-CoV-2 – så har vi lärt oss mer om viruset

Nätverket Protein Produktion Sverige (PPS) har genom sitt nationella samarbete bidragit med unik kompetens och utrustning för att producera coronavirusets olika proteiner, vilket har varit grundläggande för forskningen om viruset.

Inhibitorer för behandling

– Genom att PPS är specialiserade på proteinproduktion har vi exempelvis kunnat ta fram och kartlägga strukturen hos olika proteiner från SARS-CoV-2-viruset. På flera orter har vi producerat det viktiga SARS-CoV-2-proteaset Mpro som behövs för att hitta inhibitorer som kan fungera som möjliga läkemedel, säger Uwe Sauer, universitetslektor och koordinator för Protein Expertis Plattformen, Umeå universitet.

I en studie från oktober 2020, har forskare på Lunds universitet kunnat studera inhibitorer med hjälp av virusproteiner producerade av Lund Protein Production Platform (LP3). I studien kartlades det specifika proteinet nsp10, vilket kan hjälpa till att dels förstå hur viruset replikerar sig. Det är också användbart för att hitta inhibitorer som kan påverka proteinet och därmed viruset.

Förstå coronavirusets spikar

Coronavirusets kända spikar, som sitter som knoppar på viruspartikeln, består även de av proteiner och har kunnat produceras på flera laboratorier, bland annat på MPE Core Facility vid Sahlgrenska akademin, Göteborgs universitet. Det har möjliggjort för forskare på Sahlgrenska akademin att identifiera antikroppar mot viruset – även hos patienter som genom andra metoder testats negativt för infektion.

Det är genom spikproteinerna som viruset fäster till människans egna celler och kan därmed överföra smittan. Antikroppar är därför viktiga för att förhindra virusets spridning mellan celler.

– Inom alla proteinplattformar i Sverige har vi en hög ambition att använda vår expertis och utrustning för en snabb respons på de utmaningar som den pågående pandemin ställer, men vi ser också att de kunskaper vi får kan användas för framtida ännu okända virus, säger Malin Bäckström, enhetschef på MPE i Göteborg.

Unikt svenskt samarbete

Proteinfaciliteterna i Sverige samarbetar genom sitt nationella nätverk PPS. Det svenska samarbetet är unikt i Europa, menar Wolfgang Knecht, universitetslektor på Lunds universitet och manager på LP3:

– Så vitt vi vet så finns inget liknande universitetssamarbete på nationell nivå i andra länder i Europa. Sedan 2013 när PPS nätverket grundades har plattformarna tillsammans kunnat ge högkvalitativt forskningsstöd till en lång rad forskare inom olika fält, och vi har nu särskilt fokus på projekt som rör SARS-CoV-2.