Med proteiner som nycklar till SARS-CoV-2 – så har vi lärt oss mer om viruset
Under den pågående covid-19-pandemin har förståelsen för virusets proteiner varit en central del i forskningen om SARS-CoV-2, eftersom det är genom proteinkontakter som viruset invaderar människans celler. På flera universitet i Sverige finns faciliteter som producerar proteiner för olika forskningsprojekt och som ingår i nätverket Protein Produktion Sverige - Göteborgs universitet genom MPE Core facilties.
Fem områden inom COVID-19-forskningen där proteinproduktion varit centralt för att öka kunskapen om viruset:
1) Serologi, dvs att mäta förekomsten av antikroppar hos patienter. Har genomförts vid Göteborgs universitet samt Stockholms universitet/SciLifeLab. a
2) Testning av antikroppar som utvecklats mot SARS-CoV-2 för terapi eller diagnostik, med hjälp av proteiner som producerats inom PPS. Referens: Genomförts på Stockholms universitet/SciLifeLab.
3) Produktion av det viktigaste SARS-CoV-2 virus-proteaset (Mpro) för att hitta inhibitorer som kan fungera som läkemedelskandidater och för dess strukturbestämning. Genomförts på Karolinska institutet samt Umeå universitet.
4) Produktion av olika polymeraser för användning i PCR-diagnostik för SARS-CoV-2 viruset.Genomförts på Karolinska institutet samt Umeå universitet. b
5) Strukturbestämning av olika proteiner från SARS-CoV-2. Genomförts på Lunds universitet och Karolinska institutet. c
Tre publicerade artiklar kopplade till PPS:
a. Marklund et al. Serum-IgG responses to SARS-CoV-2 after mild and severe COVID-19 infection and analysis of IgG non-respondersPLoS One 2020 Oct 21;15(10):e0241104.
b. Alekseenko et al. Detection of SARS-CoV-2 using non-commercial RT-LAMP regents and raw samples. https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.08.22.20179507v1
c. Rogstam et al. Crystal Structure of Non-Structural Protein 10 from Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus-2 Int J Mol Sci 2020 Oct 6;21(19):7375.