Bild
Noora Neittaanmäki research
Länkstig

AI-driven digital patologi och avancerad avbildning för tidig, noggrann, och individanpassad diagnostik av hudcancer

Forskningsgrupp

Kort beskrivning

Noora Neittaanmäkis tvärvetenskapliga forskargrupp utvecklar AI-drivna lösningar och innovativa avbildningstekniker för att förbättra diagnostiken av hudcancer med särskilt focus på melanom. Genom att integrera AI i digital patologi förbättrar vi den diagnostiska noggrannheten och identifierar nya histopatologiska och genetiska markörer. Vårt mål är att skapa digitala biomarkörer som möjliggör tidigare diagnos och förbättrad prognostisering av behandlingssvar, vilket lägger grunden för mer personligt anpassad terapi. Parallellt med beräkningspatologi utvecklar vi avancerade avbildningsmetoder för hudcancerdiagnostik, bland annat ex vivo fluorescenskonfokalmikroskopi och molekylär avbildning. Dessa metoder möjliggör snabb bedömning av vävnad och karakterisering av molekylära förändringar som är kopplade till tumörprogression.

Våra forskningsområden:

Beräkningspatologi och artificiell intelligens

Digitaliseringen av patologin skapar nya möjligheter att använda artificiell intelligens (AI) för att förbättra cancerdiagnostik och samtidigt upptäcka information i rutinmässigt färgade vävnadssnitt som inte kan identifieras med konventionell histopatologisk bedömning.

Vi använder stora samlingar av digitaliserade H&E-färgade helsnittsbilder för att utveckla AI-baserade metoder för diagnostik och klassificering av hudtumörer, detektion av metastaser samt prediktion av tumörprogression och behandlingssvar. Ett särskilt fokus är melanom, där vi utvecklar beräkningsbaserade biomarkörer för att identifiera tumörer med hög metastaseringsrisk och förutsäga kliniskt relevanta molekylära förändringar och behandlingssvar.

Genom att kombinera histopatologi med kliniska, genomiska och molekylära data är målet att utveckla robusta biomarkörer som kan bidra till tidigare identifiering av aggressiva tumörer, förbättrad prognostisk bedömning och mer individanpassad cancerbehandling.

Ex vivo fluorescenskonfokalmikroskopi

Ex vivo fluorescenskonfokalmikroskopi (FCM) gör det möjligt att undersöka färsk, ofixerad vävnad och skapa högupplösta digitala bilder inom några minuter.

Vi utvecklar och utvärderar FCM för snabb pre- och intraoperativ diagnostik av hudcancer, bedömning av kirurgiska marginaler och detektion av melanommetastaser i lymfkörtlar. 

Målet är att utveckla snabbare diagnostiska arbetsflöden som kan ge kliniskt relevant information redan i samband med ett ingrepp och därmed bidra till kortare väntetider och mer effektiv och individanpassad cancervård.

Molekylär avbildning och cancerlipidomik

Förändringar i tumörcellernas metabolism är en viktig del av cancerutveckling och progression. Vi studerar särskilt hur lipidernas sammansättning och rumsliga fördelning förändras när tumörer utvecklas och blir mer aggressiva.

Med Time-of-Flight Secondary Ion Mass Spectrometry (ToF-SIMS) kan vi kartlägga lipider och andra molekyler direkt i vävnaden med hög upplösning. Den molekylära informationen kan jämföras med histopatologiska förändringar i motsvarande vävnadsområden.

I våra studier har vi identifierat förändringar i tumörcellernas lipider under melanomprogression. Genom att kombinera molekylär avbildning med histopatologi och kliniska data vill vi identifiera nya biomarkörer för tumörprogression och aggressivitet och öka förståelsen för de molekylära förändringar som sker under cancerutvecklingen.

Nuvarande medarbetare:

  • Prof John Paoli, Avdelning för Dermatovenereologi, Institutionen för Kliniska Vetenskaper, Sahlgrenska Akademin
  • Prof Roger Olofsson-Bagge, Avdelning för Kirurgi, Institutionen för Kliniska Vetenskaper, Sahlgrenska Akademin
  • Adjungerad Professor Max Levin, Avdelning för Onkologi, Institutionen för Kliniska Vetenskaper, Sahlgrenska Akademin
  • Docent Kari Nielsen, Institutionen för Kliniska Vetenskaper, Lund Universitet
  • Docent Ida Häggström, Chalmers tekniska högskola och Gothenburg Universitet
  • Prof John Fletcher, Avdelning för kemi och Molekylärbiologi, Göteborgs universitet
  • Associate professor Leonardo Vinicius Monteiro de Assis, Department of Chemistry and Molecular Biology, University of Gothenburg
  • Associate Professor Aino Rönkä, Department of Oncology, University of Eastern Finland and Kuopio University Hospital
  • Associate Professor Jaana Hartikainen, Research Director; Institute of Clinical Medicine, School of Medicine, Faculty of Health Sciences, University of Eastern Finland
  • Associate Professor Gabriele Campanella, Senior data scientist, Icahn School of Medicine at Mount Sinai, NYC
  • Professor Klaus Busan, Department of Pathology, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, NYC

Gruppmedlemmar

Kajsa Villiamsson, doktorand

Filip Dahlen, doktorand

Maja Markwart, doktorand

Jenna Hongisto, doktorand

Simon Uzoni, doktorand

Jan Siarov, postdoc-forskare 

Nadin Albanna, forskare

Ramona Al-Baalbaki, forsknings-BMA

Filmon Yacob, data scientist, AI expert