Jon Lundstrøm tilldelas årets avhandlingspris

Bild

Grattis! Hur känns det att få årets avhandlingspris?

Jag är både glad och stolt över att ha blivit utvald till det här priset! En doktorandutbildning är en lång och krävande resa, så det känns fantastiskt att få den här uppskattningen för fyra års hårt arbete. Jag är väldigt tacksam för allt stöd och alla bidrag från kollegor och samarbetspartners genom åren som har gjort forskningen möjlig.

Vad handlar din avhandling om?

Glykaner, eller komplexa kolhydrater, utgör en tredje typ av biologiska molekyler vid sidan av nukleinsyror (DNA och RNA) och proteiner. Till skillnad från dessa, som byggs efter en genetisk mall, sätts glykaner ihop av enzymer på ett mer dynamiskt och varierat sätt. Genom att fästa på och påverka andra biomolekyler, som proteiner och fetter, spelar glykaner en viktig roll i många biologiska processer – från infektioner och cancer till immunförsvarets funktion och kroppens utveckling. 
I min avhandling kombinerar jag datorbaserade analyser och experimentella studier för att förstå hur glykaner fungerar. Vi har bland annat studerat hur glykaner samverkar med sin omgivning och genomfört experiment på ett tidigare okänt glykbindande protein som vi har döpt till Cucumis melo agglutinin 1 (CMA1). Dessutom har vi utvecklat nya deep learning-metoder för att förutsäga hur glykaner och proteiner interagerar. Vi har också undersökt hur celler fäster glykaner på andra molekyler och sett att processen är mycket mer omfattande än man tidigare trott – något som öppnar för flera spännande framtida forskningsområden.

Hur kan din forskning bidra till samhället?

Glykaner har viktiga roller inom många delar av biologin, men i många fall saknas fortfarande en fullständig förståelse för de molekylära mekanismerna bakom deras olika funktioner. Dessutom är glykaner tekniskt svåra att studera. Genom vårt arbete försöker vi fylla dessa kunskapsluckor – med det långsiktiga målet att bidra till bättre diagnostik och behandlingar.

Vad gör du just nu?

Jag arbetar fortfarande i Daniel Bojars forskargrupp, där jag just nu avslutar och färdigställer projekt från min doktorandtid. 
 

Motivering till pristagaren

Priset för 2025 tilldelas Jon Lundstrøm för hans doktorsavhandling “Glycans at the Core: Computational-Experimental Investigations of Complex Carbohydrates”. Avhandlingen fördjupar sig i struktur och funktion hos glykokonjugat – cellbiologins ”mörka materia”. Glykokonjugater är molekyler som består av en kolhydratdel bunden till ett protein eller en lipid. De uppvisar en enastående komplexitet, som vida överträffar nukleinsyror och proteiner. De analytiska metoderna räcker i dagsläget inte till för att fullt ut utforska glykokonjugatens strukturella mångfald. Dessutom är deras funktioner till största delen fortfarande okända. Den enorma variationen hos glykokonjugat är ett olöst mysterium: varför behöver organismer ett så oerhört stort antal olika molekyler – och behöver de verkligen det? Glykokonjugat har visats ha funktioner inom immunitet (till exempel blodgrupper), försvar mot patogener och cell-cell-adhesion, men många av deras roller kan mycket väl återstå att upptäckas.

I sin avhandling kombinerar Jon Lundstrøm beräkningsmässiga och artificiell intelligens-baserade metoder för strukturell klassificering av glykaner med experimentell cell- och molekylärbiologi. Hans arbete omfattar utveckling av programvara för visualisering av glykaner, och en djupinlärningsbaserad metod för förutsägelse av protein-glykanbindningar. Det innehåller också framsteg inom cellbiologi, baserade på experimentella metoder från molekylärbiologi till analytisk kemi. Det är värt att nämna att Jon Lundstrøm har visat en exceptionell produktivitet under sin doktorandtid. Förutom de högkvalitativa artiklar som ingår i hans avhandling har han publicerat fem vetenskapliga artiklar som försteförfattare i peer review-granskade tidskrifter – en ovanlig bedrift.

Hans doktorsavhandling är skriven i en klar och lättförståelig stil, med tydliga förklaringar av grundläggande begrepp. Den visar på kopplingar till många mer komplexa frågor och speglar mångsidigheten i hans forskningsarbete. Vid avhandlingsförsvaret presenterades arbetet på ett mycket pedagogiskt sätt med illustrationer på professionell nivå, vilket uppskattades stort av både åhörarna och betygsnämnden.

Jon Lundstrøm är en mycket värdig mottagare av priset för bästa doktorsavhandling.