Molekylär epidemiologi

Kursen är en valbar kurs inom Mastersprogrammet i tillämpad biostatistik (M2STA). Kursen ges även som fristående kurs på avancerad nivå.

Behörighetskraven för kursen är en kandidatexamen om minst 180 högskolepoäng inom hälsovetenskapligt, ekonomiskt, naturvetenskapligt, eller ingenjörsvetenskapligt huvudområde samt en kurs i statistik eller kvantitativa metoder om minst 7,5 högskolepoäng. Vidare krävs R-programmering om minst 2 högskolepoäng eller motsvarande, kurs i regressionsanalys om minst 2hp eller motsvarande, Engelska B/Engelska 6 eller motsvarande, och Matematik 3b/3c eller motsvarande.

Kursen ger en introduktion till viktiga begrepp, metoder och tillämpningar inom molekylär epidemiologi. Modern medicinsk forskning bygger ofta på analyser av storskaliga molekylära data, vilket är ett område där specialiserade statistiska analyser krävs. Kursen går översiktligt igenom de grunder för cellens biologi med fokus på DNA, RNA och proteinuttryck som krävs för analys och tolkning av resultat. Kursen ger exempel på kopplingen mellan genotyp, protein och fenotyp, och proteiners olika roller i cellens funktioner. Kursen fokuserar på hur genetiska analyser såsom genome wide associations studies (GWAS) och mendelsk randomisering (MR) kan används som verktyg för epidemiologiska studier och kausal inferens. Vidare behandlas biomarkörer och storskaliga analyser av molekylär data (omics).

Efter godkänd kurs ska studenten kunna:

Kunskap och förståelse

• Beskriva relevanta begrepp och processer inom cellens biologi kopplat till ärftlighet och uttryck av proteiner
• Redogöra för hur genetisk variation och uttryck kan kopplas till sjukdom
• Förklara principer för och skillnad mellan statistisk analys av enstaka biomarkörer och storskalig analys av omics data.

Färdigheter och förmåga

• Utföra mendelsk randomisering baserat på tillgängliga summary data
• Tolka resultat från GWAS och mendelsk randomisering

Värderingsförmåga och förhållningssätt

• Reflektera över olika aspekter av storskaliga studier, inklusive genetiska studier, kopplat till datainsamling, etik samt tolkning.
• Diskutera styrkor och begränsningar med genetiska studier för kausal inferens.

Undervisningen består av föreläsningar, praktiska datorbaserade sessioner, interaktiva diskussioner och seminarier.

Undervisningsspråk: engelska

Kursen examineras genom:

• en individuell skriftlig salstentamen (3 hp)
• aktivt deltagande i ett obligatoriskt seminarium och en obligatorisk datorövning (1,0 hp)

Komplettering av icke godkända obligatoriska moment kommer att erbjudas och ska utföras enligt lärarens instruktioner.

Om en student som har underkänts två gånger på samma examinerande moment önskar byta examinator inför nästa examinationstillfälle ska en sådan begäran bifallas om det inte finns särskilda skäl däremot (6 kap. 22 § HF).

Om en student har fått besked om pedagogiskt stöd från Göteborgs universitet med rekommendation om anpassad examination och/eller anpassad examinationsform kan examinator, i det fall det är förenligt med kursens lärandemål och förutsatt att inte orimliga resurser krävs, besluta att bevilja studenten anpassad examination och/eller anpassad examinationsform.

Om en kurs har avvecklats eller genomgått en större förändring ska studenten erbjudas minst två examinationstillfällen, utöver ordinarie examinationstillfälle. Dessa tillfällen fördelas under en tid av minst ett år, dock som längst två år efter det att kursen avvecklats/förändrats. Vad gäller praktik och verksamhetsförlagd utbildning (VFU) gäller motsvarande, men med begränsning till endast ett ytterligare examinationstillfälle.

Om en student har fått besked om att denne uppfyller kraven för att vara student vid Riksidrottsuniversitetet (RIU-student) har examinator rätt att besluta om anpassning vid examination, om detta görs i enlighet med Lokala regler gällande RIU-studenter vid Göteborgs universitet.

Betygsskalan består av: Väl godkänd (VG), Godkänd (G) och Underkänd (U). De obligatoriska momenten seminarium och datorövning (1,0 hp) betygsätts med Godkänd och Underkänd, den individuella skriftliga tentamen (3 hp) betygsätts med Väl godkänd, Godkänd och Underkänd.

För att få betyget Godkänd på kursen krävs betyget Godkänd på seminariet och datorövningen samt på den skriftliga tentamen. För att få betyget Väl godkänd på kursen krävs betyget Godkänd på seminariet och datorlövningen samt betyget Väl godkänd på den individuella skriftliga tentamen

Kursutvärderingen genomförs i form av ett anonymt frågeformulär. En sammanställning av frågeformuläret görs av kursansvarig. Resultatet och eventuella förändringar i kursens upplägg ska förmedlas både till de studenter som genomförde värderingen och till de studenter som ska påbörja kursen.

Varje deltagare behöver tillgång till en bärbar dator (minst 8 GB RAM rekommenderas) med mjukvaran R samt en integrerad utvecklingsmiljö (såsom RStudio eller Positron) installerat. Förväntade förkunskaper i statistik omfattar förståelse för principerna för statistisk hypotesprövning, konstruktion av konfidensintervall, förståelse för begreppet p-värde och god kännedom om linjär regression.