VR kluster protein: Proteinveckning och felveckning

Mätning och prediktion på singelmolekylnivå

Proteiner måste veckas till rätt tredimensionell struktur för att fungera. När denna process misslyckas kan sjukdomar som Alzheimers sjukdom, Parkinsons sjukdom och många former av cancer uppstå.

Även om AlphaFold idag kan förutsäga statiska proteinstrukturer kan tekniken fortfarande inte förklara hur proteiner veckas, varför veckningen ibland misslyckas eller hur detta kan leda till aggregering – kunskap som är avgörande för att förstå och förebygga felveckning.

Vårt forskningskluster samlar ledande svenska team inom biofysik, simuleringar och artificiell intelligens för att följa proteinveckning i realtid och med singelmolekylupplösning.

Genom att använda högupplöst kraftspektroskopi, flerskalig mikroskopi, nanokanalteknologier och djupinlärningsmodeller kartlägger vi de grundläggande reglerna för korrekt veckning och felveckning. Målet är att möjliggöra nya diagnostiska metoder, behandlingar och förebyggande strategier.

När proteinveckningsforskningen nu går in i en ny era präglad av realtidsmätningar och AI-drivna metoder har Sverige en unik möjlighet att påverka det globala forskningslandskapet. Genom att samordna nationell expertis och infrastruktur positionerar vårt kluster Sverige som en ledande aktör i denna utveckling.

Fokusområden

• Proteindynamik i realtid – singelmolekylär kraftspektroskopi och optiska metoder för att identifiera veckningsintermediärer och felveckade tillstånd.
• Flerskalig avbildning – levande cell- och superupplösningsmikroskopi, singelmolekyl-FRET, nanokanaler samt integration med data från cryo-EM, NMR och synkrotronljus.
• AI och simuleringar – djupinlärning och molekyldynamik för att förutsäga veckningsvägar och felveckningsprocesser från sekvens till struktur och funktion.
• Klinisk translation och biomarkörer – koppling av veckningssignaturer till patientdata och proteomik inom neurodegenerativa och andra felveckningssjukdomar.
• Etik och samhälle – samarbete med humaniora och samhällsvetenskap kring ansvarsfull AI, dataanvändning och långsiktiga samhällseffekter.

Intresse för samarbete och utbyte

• Delade metoder och plattformar för avbildning, singelmolekylmätningar och AI-baserad analys.
• Gemensamma ansökningar inom sjukdomsmodeller, kliniska kohorter samt stora avbildnings- och proteomikdatamängder.
• Etik, policyutveckling och framtidsanalys för AI-baserade proteinteknologier.
• Utbildning och mobilitet – gemensamt utvecklade doktorandkurser, workshops och utbyten i gränslandet mellan biofysik, AI och medicin.

Konferens i mars 2026

Välkommen att delta i vår konferens i Stockholm den 11–13 mars 2026 och bidra till att forma framtidens svenska plattform för forskning om proteinveckning.