Grupp Carolina Guibentif

Sammanfattning av forskning

Vi studerar uppkomstmekanismer för transformation av blodstamceller före födelsen som en viktig orsak till barnleukemi. Grundläggande studier om hur prenatal hematopoes normalt sker och regleras på anatomiskt olika platser under olika faser av fostrets utveckling ingår i projektet. 

För mer information om vår forskning, se den engelska versionen av sidan.

Forskningsverktyg och resurser

Vår forskning involverar både musmodeller för utvecklingsbiologiska studier in vivo och experiment på humana pluripotenta stamceller. Framträdande tekniker som används är flerfärgflödescytometri för cellsortering, singelcellanalys av transkriptom och kromatinstillgänglighet samt hemapoetiska funktionsanalyser.

Nuvarande gruppmedlemmar

Carolina Guibentif, PhD, Forskargruppledare (Junior PI)
Anna Hogmalm, PhD
Pavan Kumar, PhD, Postdoc
Robel Tesfaye, PhD, Postdoc
Anuntxi Monsalve, Doktorand
Athul Venu Beena, Doktorand
Elin Hilpold Berntsson, Doktorand
 

Utvalda publikationer

1. Resolving thyroid lineage cell trajectories merging into a dual endocrine gland in mammals. 
   Lobo M, Johansson E, Kumari S, Schoultz E, Ahlinder I, Liang S, Carlsson T, Johansson BR, Marotta P, De Felice M, Dahlberg J, Guibentif C, Fagman H, Maehr R, Nilsson M. Nature Communications. 2026 May 25;17(1):6811. 
    
2. A single-cell and tissue-scale analysis suite resolves Mixl1's role in heart development. 
   Strauss ME, Ton MN, Mason S, Bagri J, Harland LTG, Imaz-Rosshandler I, Wilson NK, Nichols J, Tyser RCV, Göttgens B, Marioni JC, Guibentif C. iScience. 2025 Apr 10;28(5):112397. 
    
3. Defective ribosome assembly impairs leukemia progression in a murine model of acute myeloid leukemia. 
   Sjövall D, Ghosh S, Fernandez-Fuentes N, Velasco-Hernandez T, Hogmalm A, Menendez P, Hansson J, Guibentif C, Jaako P. Cell Reports. 2024 Nov 26;43(11):114864.
    
4. Tracking early mammalian organogenesis - prediction and validation of differentiation trajectories at whole organism scale.
   Imaz-Rosshandler I*, Rode C*, Guibentif C*, Harland LTG*, Ton MN, Dhapola P, Keitley D, Argelaguet R, Calero-Nieto FJ, Nichols J, Marioni JC, de Bruijn MFTR, Göttgens B. Development. 2024 Feb 1;151(3):dev201867. (* equal contribution)
    
5. An atlas of rabbit development as a model for single-cell comparative genomics.
   Ton MN, Keitley D, Theeuwes B, Guibentif C, Ahnfelt-Rønne J, Andreassen TK, Calero-Nieto FJ, Imaz-Rosshandler I, Pijuan-Sala B, Nichols J, Benito-Gutiérrez È, Marioni JC, Göttgens B.Nat Cell Biol. 2023 Jul;25(7):1061-1072.
    
6. Stabilized mosaic single-cell data integration using unshared features.
   Ghazanfar S, Guibentif C, Marioni JC.Nat Biotechnol. 2023 May 25. 
    
7. Coordinated Changes in Gene Expression Kinetics Underlie both Mouse and Human Erythroid Maturation.
   Barile M, Imaz-Rosshandler I., Inzani I., Ghazanfar S., John C. Marioni, Guibentif C.*, Göttgens B*. Genome Biology. 2021 Vol. 22, issue 1, p197 (* co-corresponding authors)
    
8. Integration of spatial and single cell transcriptomic data elucidates mouse organogenesis. 
   Lohoff T., Ghazanfar S., Missarova A., Koulena N., Pierson N., Griffiths J.A., Bardot E., Eng C-H.L., Tyser R.C.V., Argelaguet R., Guibentif C., Srivinas S., Briscoe J., Simons B.D., Hadjantonakis A.K., Goettgens B., Reik W., Nichols J., Cai L., Marioni J.C. Nature Biotechnology. 2021
    
9. Diverse Routes towards Early Somites in the Mouse Embryo.
   Guibentif C.*, Griffiths J.A.*, Imaz-Rosshandler I., Ghazanfar S., Wilson V., Nichols J., Göttgens B., Marioni J.C. Developmental Cell. 2021 Vol. 56, issue 1, p141-153 (* equal contribution)
    
10. A single-cell molecular map of mouse gastrulation and early organogenesis.
    Pijuan-Sala B.*, Griffiths J.A.*, Guibentif C.*, Hiscock TW, Jawaid W, Calero-Nieto FJ, Mulas C, Ibarra-Soria X, Tyser RCV, Ho DLL, Reik W, Srinivas S, Simons BD, Nichols J, Marioni JC, Göttgens B. Nature. 2019 Vol. 566, issue 7745, p490-495 (* equal contribution)
     
11. Single-Cell Analysis Identifies Distinct Stages of Human Endothelial-to-Hematopoietic Transition.
    Guibentif C., Rönn R.E., Böiers C., Lang S., Saxena S., Soneji S., Enver T., Karlsson G., Woods N.-B.  Cell Reports. 2017 Vol. 19, issue 1, p10–19

Fler publikationer från grupp Carolina Guibentif på PubMed