R programmering med exempel från hälsovetenskaper

Kursen ges som en fristående kurs på avancerad nivå och riktar sig till studenter inom medicin och övriga hälsovetenskaper, samhällskunskap, naturvetenskap, ekonomi, ingenjörskunskap eller liknande men ett intresse av att lära sig analysera data med R. Kursen kommer huvudsakligen ges med exempel från life science och hälsa.

Kursens förkunskapskrav är kurser omfattande minst 120 högskolepoäng och Engelska B/Engelska 6.

Kursens fokus ligger på att introducera det statistiska programmeringsspråket R som ett verktyg för att utföra reproducerbara statistiska analyser. Statistisk programmering är en nödvändig kunskap för att kunna jobba med dataanalys, till exempel statistiska analyser, maskininlärning och artificiell intelligens. Inom hälsovetenskaperna har R blivit ett nyckelverktyg för att hantera och analysera data. Kursens innehåll sträcker sig från att importera data, processa och städa data, transformera och skapa nya variabler till att utföra statistiska analyser och sammanfatta och visualisera resultaten. Ni kommer lära er grunderna i R programmering såsom data typer och strukturer, kontrollsatser, skriva egna funktioner och skapa reproducerbar kod. Genomgående i kursen kommer exempel huvudsakligen komma från hälsovetenskaperna. I kursen kommer ni lära er utföra statistiska analyser, men de statistiska metoderna kommer inte gås igenom i detalj

Efter godkänd kurs ska studenten kunna:

Kunskap och förståelse

• Beskriva de vanligaste datatyperna och objekten, och de vanligaste filformaten för Rscript och data
• Förklara hur man installerar och uppdaterar paket
• Beskriva hur man hittar och använder dokumentation om funktioner och paket.
• Ge exempel på vanliga funktioner och paket för att göra grundläggande statistisk analys och visualiseringar

Färdigheter och förmåga

• Skriva R script och skapa egna funktioner
• Använda R för att importera data från typiska externa dataformat.
• Processa och transformera data i R genom att konvertera tabeller och beräkna nya variabler
• Göra statistiska analyser med R
• Summera och presentera resultat som informativa tabeller och figurer med hjälp av R

Värderingsförmåga och förhållningssätt

• Kritiskt diskutera användandet av öppen programvara för statistiska analyser
• Välja tillvägagångsätt för att utveckla kod för att göra stringenta och reproducerbara analyser, avseende till exempel dokumentation, namngivning, upplägg av programkod och användande av funktioner

Kursen ges online med undervisning dels i form av förinspelat material och dels genom schemalagda online-föreläsningar, seminarier och datorövningar. Undervisningen sker på digitala plattformar.

Undervisningsspråk: engelska

Fyra obligatoriska datorövningar med skriftlig och muntlig presentation.

På kursen ges något av betygen Godkänd (G) och Underkänd (U).

Kursvärderingen sker i form av en anonym skriftlig enkät. Sammanställning av enkäten görs av kursansvarig lärare. Sammanställning av kursenkät och eventuella förändringar i kursens upplägg ska förmedlas både till de studenter som genomförde värderingen och till de studenter som ska påbörja kursen.

Tillgång till en dator med internetuppkoppling, webkamera och mikrofon, samt med möjlighet att installera R och RStudio, är nödvändigt för att kunna genomföra kursen.

Om en student som har underkänts två gånger på samma examinerande moment önskar byta examinator inför nästa examinationstillfälle ska en sådan begäran bifallas om det inte finns särskilda skäl däremot (6 kap. 22 § HF).

Om en student har fått besked om pedagogiskt stöd från Göteborgs universitet med rekommendation om anpassad examination och/eller anpassad examinationsform kan examinator, i det fall det är förenligt med kursens lärandemål och förutsatt att inte orimliga resurser krävs, besluta att bevilja studenten anpassad examination och/eller anpassad examinationsform.

Om en kurs har avvecklats eller genomgått en större förändring ska studenten erbjudas minst två examinationstillfällen, utöver ordinarie examinationstillfälle. Dessa tillfällen fördelas under en tid av minst ett år, dock som längst två år efter det att kursen avvecklats/förändrats. Vad gäller praktik och verksamhetsförlagd utbildning (VFU) gäller motsvarande, men med begränsning till endast ett ytterligare examinationstillfälle.

Om en student har fått besked om att denne uppfyller kraven för att vara student vid Riksidrottsuniversitetet (RIU-student) har examinator rätt att besluta om anpassning vid examination, om detta görs i enlighet med Lokala regler gällande RIU-studenter vid Göteborgs universitet.