Johanna Hörberg
Om Johanna Hörberg
Jag har sedan tidigare en kandidat- och masterexamen i organisk och läkemedelskemi. Nu gör jag mina PhD studier i gruppen beräkningskemi och teoretisk biokemi, där jag även gjorde mitt masterarbete. Jag intresserar mig främst av att förstå mekanismer för biologiska processer.
Handledare: Dr Anna Reymer och Prof. Leif Eriksson.
Forskning
Mitt PhD projekt består av att med hjälp av beräkningsmetoder (huvudsakligen molekylärdynamiska simuleringar) erhålla mekanistiska aspekter för reglering av DNA transkription på molekylär nivå. Transkription regleras av transkriptionsfaktoer – en klass proteiner som känner igen och binder med hög specificitet korta DNA sekvenser (såkallade svarselement) för att initiera transkription av en gen. I vår grupp försöker vi förstå hur sekvensspecifik dynamik av DNA kan reglera specifik igenkänning av transkriptionsfakorer och hur protein-DNA dynamik kan kopplas till genuttryckningsnivåer
-
Sequence-specific dynamics of DNA response elements and their flanking sites regulate the recognition by AP-1 transcription
factors.
Johanna Hörberg, Kevin Moreau, Markus J. Tamás, Anna Reymer
Nucleic acids research - 2021-01-01 -
Specifically bound BZIP transcription factors modulate DNA supercoiling
transitions
Johanna Hörberg, Anna Reymer
Scientific Reports - 2020-01-01 -
New insights on human IRE1 tetramer structures based on molecular
modeling
Antonio Carlesso, Johanna Hörberg, Anna Reymer, Leif A Eriksson
Scientific Reports - 2020-01-01 -
Control of anterior GRadient 2 (AGR2) dimerization links endoplasmic reticulum proteostasis to
inflammation
M. Maurel, J. Obacz, T. Avril, Y. P. Ding, O. Papadodima, X. Treton, F. Daniel, E. Pilalis, Johanna Hörberg, W. Y. Hou, M. C. Beauchamp, J. Tourneur-Marsille, D. Cazals-Hatem, L. Sommerova, A. Samali, J. Tavernier, R. Hrstka, A. Dupont, D. Fessart, F. Delom, M. E. Fernandez-Zapico, G. Jansen, Leif A Eriksson, D. Y. Thomas, L. Jerome-Majewska, T. Hupp, A. Chatziioannou, E. Chevet, E. Ogier-Denis
EMBO Molecular Medicine - 2019-01-01 -
A sequence environment modulates the impact of methylation on the torsional rigidity of
DNA
Johanna Hörberg, Anna Reymer
Chemical Communications - 2018-01-01 -
QM/MM Studies of Dph5-A Promiscuous Methyltransferase in the Eukaryotic Biosynthetic Pathway of
Diphthamide
Johanna Hörberg, P. Saenz-Mendez, Leif A Eriksson
Journal of Chemical Information and Modeling - 2018-01-01 -
Visible-Light-Mediated Photocatalytic Difunctionalization of Olefins by Radical Acylarylation and Tandem Acylation/Semipinacol
Rearrangement
Giulia Bergonzini, Carlo Cassani, Haldor Lorimer-Olsson, Johanna Hörberg, Carl Johan Wallentin
Chemistry-a European Journal - 2016-01-01