Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

The ancillary N-terminal … - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

The ancillary N-terminal region of the yeast AP-1 transcription factor Yap8 contributes to its DNA binding specificity.

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Ewa Maciaszczyk-Dziubinska
Anna Reymer
Nallani Vijay Kumar
Wojciech Białek
Katarzyna Mizio
Markus J. Tamás
Robert Wysocki
Publicerad i Nucleic acids research
Volym 48
Nummer/häfte 10
Sidor 5426-5441
ISSN 1362-4962
Publiceringsår 2020
Publicerad vid Institutionen för kemi och molekylärbiologi
Sidor 5426-5441
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.1093/nar/gkaa316
www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.f...
Ämneskategorier Mikrobiologi, Biokemi och molekylärbiologi, Fysikalisk kemi

Sammanfattning

Activator protein 1 (AP-1) is one of the largest families of basic leucine zipper (bZIP) transcription factors in eukaryotic cells. How AP-1 proteins achieve target DNA binding specificity remains elusive. In Saccharomyces cerevisiae, the AP-1-like protein (Yap) family comprises eight members (Yap1 to Yap8) that display distinct genomic target sites despite high sequence homology of their DNA binding bZIP domains. In contrast to the other members of the Yap family, which preferentially bind to short (7-8 bp) DNA motifs, Yap8 binds to an unusually long DNA motif (13 bp). It has been unclear what determines this unique specificity of Yap8. In this work, we use molecular and biochemical analyses combined with computer-based structural design and molecular dynamics simulations of Yap8-DNA interactions to better understand the structural basis of DNA binding specificity determinants. We identify specific residues in the N-terminal tail preceding the basic region, which define stable association of Yap8 with its target promoter. We propose that the N-terminal tail directly interacts with DNA and stabilizes Yap8 binding to the 13 bp motif. Thus, beside the core basic region, the adjacent N-terminal region contributes to alternative DNA binding selectivity within the AP-1 family.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?