Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Whole Genome Sequence of … - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Whole Genome Sequence of Marinobacter salarius Strain SMR5, Shown to Promote Growth in its Diatom Host.

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Mats H. Töpel
Matthew I. M. Pinder
Oskar N. Johansson
Olga Kourtchenko
Anna Godhe
Adrian K Clarke
Publicerad i Journal of Genomics
Volym 7
Sidor 60-63
ISSN 1839-9940
Publiceringsår 2019
Publicerad vid Institutionen för marina vetenskaper
Institutionen för biologi och miljövetenskap
Sidor 60-63
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.7150/jgen.39039
www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.f...
Ämneskategorier Bioinformatik och systembiologi

Sammanfattning

Attempts to obtain axenic cultures of the marine diatom Skeletonema marinoi often result in poor growth, indicating the importance of the microbiome to the growth of its host. In order to identify the precise roles played by these associated bacteria, individual strains were isolated, cultured and sequenced. We report the genome of one such strain - SMR5, isolated from a culture of S. marinoi strain R05AC sampled from top layer sediments of the Swedish west coast. Its genome of 4,630,160 bp consists of a circular chromosome and one circular plasmid, and 4,263 CDSs were inferred in the annotation. Comparison of 16S rRNA sequences and other markers, along with phylotaxonomic analysis, leads us to place strain SMR5 in the taxon Marinobacter salarius. Pathway analysis and previous experimental work suggest that this strain may produce a growth factor, as well as improve iron availability for its host via siderophores.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?