Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Genome Sequence of Kordia… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Genome Sequence of Kordia sp. Strain SMS9 Identified in a Non-Axenic Culture of the Diatom Skeletonema marinoi.

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Matthew I. M. Pinder
Oskar N. Johansson
Alvar Almstedt
Olga Kourtchenko
Adrian K Clarke
Anna Godhe
Mats H. Töpel
Publicerad i Journal of genomics
Volym 7
Sidor 46-49
ISSN 1839-9940
Publiceringsår 2019
Publicerad vid Institutionen för marina vetenskaper
Institutionen för biologi och miljövetenskap
Sidor 46-49
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.7150/jgen.35061
www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.f...
Ämneskategorier Bioinformatik och systembiologi

Sammanfattning

Initial efforts to sequence the genome of the marine diatom Skeletonema marinoi were hampered by the presence of genetic material from bacteria, and there was sufficient material from some of these bacteria to enable the assembly of full chromosomes. Here, we report the genome of strain SMS9, one such bacterial species identified in a non-axenic culture of S. marinoi strain ST54. Its 5,482,391 bp circular chromosome contains 4,641 CDSs, and has a G+C content of 35.6%. Based on 16S rRNA comparison, phylotaxonomic analysis, and the genome similarity metrics dDDH and OrthoANI, we place this strain in the genus Kordia, and to the best of our knowledge, this is the first Kordia species to be initially described from European waters. As attempts to culture this strain have failed, however, the specifics of its relationship with S. marinoi are still uncertain.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?