Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Complete Genome Sequence … - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Complete Genome Sequence of Novel Sulfitobacter pseudonitzschiae Strain SMR1, Isolated from a Culture of the Marine Diatom Skeletonema marinoi.

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Mats H. Töpel
Matthew I. M. Pinder
Oskar N. Johansson
Olga Kourtchenko
Adrian K Clarke
Anna Godhe
Publicerad i Journal of Genomics
Volym 7
Sidor 7-10
ISSN 1839-9940
Publiceringsår 2019
Publicerad vid Institutionen för marina vetenskaper
Institutionen för biologi och miljövetenskap
Sidor 7-10
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.7150/jgen.30559
www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.f...
Ämneskategorier Bioinformatik och systembiologi

Sammanfattning

When studying diatoms, an important consideration is the role of associated bacteria in the diatom-microbiome holobiont. To that end, bacteria isolated from a culture of Skeletonema marinoi strain R05AC were sequenced, one of which being bacterial strain SMR1, presented here. The genome consists of a circular chromosome and seven circular plasmids, totalling 5,121,602 bp. After phylotaxonomic analysis and 16S rRNA sequence comparison, we place this strain in the taxon Sulfitobacter pseudonitzschiae on account of similarity to the type strain. The annotated genome suggests similar interactions between strain SMR1 and its host diatom as have been shown previously in diatom-associated Sulfitobacter, for example bacterial production of growth hormone for its host, and breakdown of diatom-derived DMSP by Sulfitobacter for use as a sulfur source.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?