Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Whole-Genome Sequence of … - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Whole-Genome Sequence of the Novel Antarctobacter heliothermus Strain SMS3, Found in Association with the Marine Diatom Skeletonema marinoi.

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Mats H. Töpel
Matthew I. M. Pinder
Oskar N. Johansson
Olga Kourtchenko
Anna Godhe
Adrian K Clarke
Publicerad i Journal of Genomics
Volym 6
Sidor 113-116
ISSN 1839-9940
Publiceringsår 2018
Publicerad vid Institutionen för marina vetenskaper
Institutionen för biologi och miljövetenskap
Sidor 113-116
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.7150/jgen.27637
www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.f...
Ämnesord Antarctobacter; Diatom; Microbiome; Skeletonema; Whole Genome Sequencing
Ämneskategorier Bioinformatik och systembiologi

Sammanfattning

As part of an ongoing investigation into the microbiome of the marine diatom Skeletonema marinoi, the bacterial strain SMS3 was isolated from a culture of S. marinoi strain ST54, which had been propagated from a sample of top layer marine sediments taken from the Swedish west coast. We present here the sequenced genome of this bacterium, which we place in the taxon Antarctobacter heliothermus, based on a phylotaxonomic analysis and its high 16S rRNA sequence similarity to the A. heliothermus type strain DSM 11445T. Its 5,331,190 bp genome consists of a circular chromosome and three circular plasmids, and contains 5,019 CDSs. Strain SMS3 contains a phosphatidylcholine synthase gene, as well as genes involved in DMSP degradation, both of which imply a potential symbiotic relationship with its host.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?