Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Complete genome sequence … - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Complete genome sequence of the marine Rhodococcus sp H-CA8f isolated from Comau fjord in Northern Patagonia, Chile

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare A. Undabarrena
Francisco Salvà-Serra
Daniel Jaen-Luchoro
E. Castro-Nallar
K. N. Mendez
R. Valencia
J. A. Ugalde
Edward R.B. Moore
M. Seeger
B. Camara
Publicerad i Marine Genomics
Volym 40
Sidor 13-17
ISSN 1874-7787
Publiceringsår 2018
Publicerad vid Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar
Sidor 13-17
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.1016/j.margen.2018.01...
Ämnesord Rhodococcus, Marine actinobacteria, Comau fjord, Novel mega-plasmid, PacBio sequencing, functional annotation, biodegradation, proteins, database, rha1, Genetics & Heredity, Marine & Freshwater Biology, ates of america, v103, p15582
Ämneskategorier Marin ekologi, Genetik och förädling

Sammanfattning

Rhodococcus sp. H-CA8f was isolated from marine sediments obtained from the Comau fjord, located in Northern Chilean Patagonia. Whole-genome sequencing was achieved using PacBio RS II platform, comprising one closed, complete chromosome of 6,19 Mbp with a 62.45% G + C content. The chromosome harbours several metabolic pathways providing a wide catabolic potential, where the upper biphenyl route is described. Also, Rhodococcus sp. H-CA8f bears one linear mega-plasmid of 301 Kbp and 62.34% of G + C content, where genomic analyses demonstrated that it is constituted mostly by putative ORFs with unknown functions, representing a novel genetic feature. These genetic characteristics provide relevant insights regarding Chilean marine actinobacterial strains.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?