Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Distribution of label spa… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Distribution of label spacings for genome mapping in nanochannels

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare D. Ödman
E. Werner
K. D. Dorfman
C. R. Doering
Bernhard Mehlig
Publicerad i Biomicrofluidics
Volym 12
Nummer/häfte 3
ISSN 1932-1058
Publiceringsår 2018
Publicerad vid Institutionen för fysik (GU)
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.1063/1.5038417
Ämnesord single dna-molecules, nanofluidic channels, semiflexible polymer, conformation, confinement, simulation, manipulation, statistics, diffusion, dynamics, Biochemistry & Molecular Biology, Biophysics, Science & Technology -, Other Topics, Physics
Ämneskategorier Fysik

Sammanfattning

In genome mapping experiments, long DNA molecules are stretched by confining them to very narrow channels, so that the locations of sequence-specific fluorescent labels along the channel axis provide large-scale genomic information. It is difficult, however, to make the channels narrow enough so that the DNA molecule is fully stretched. In practice, its conformations may form hairpins that change the spacings between internal segments of the DNA molecule, and thus the label locations along the channel axis. Here, we describe a theory for the distribution of label spacings that explains the heavy tails observed in distributions of label spacings in genome mapping experiments. Published by AIP Publishing.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?