Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Hairpins in the conformat… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Hairpins in the conformations of a confined polymer

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Erik Werner
A. Jain
A. Muralidhar
K. Frykholm
Toby St Clere Smithe
J. Fritzsche
F. Westerlund
K. D. Dorfman
Bernhard Mehlig
Publicerad i Biomicrofluidics
Volym 12
Nummer/häfte 2
ISSN 1932-1058
Publiceringsår 2018
Publicerad vid Institutionen för fysik (GU)
Språk en
Länkar https://doi.org/10.1063/1.5018787
Ämnesord Conformations, Intelligent systems, Monte Carlo methods, Confined polymers, DNA molecules, Narrow channel, Non-Gaussian, Semi-flexible polymers, Simple modeling, Wormlike chain, Polymers
Ämneskategorier Mikrobiologi, Polymerkemi

Sammanfattning

If a semiflexible polymer confined to a narrow channel bends around by 180°, the polymer is said to exhibit a hairpin. The equilibrium extension statistics of the confined polymer are well understood when hairpins are vanishingly rare or when they are plentiful. Here, we analyze the extension statistics in the intermediate situation via experiments with DNA coated by the protein RecA, which enhances the stiffness of the DNA molecule by approximately one order of magnitude. We find that the extension distribution is highly non-Gaussian, in good agreement with Monte-Carlo simulations of confined discrete wormlike chains. We develop a simple model that qualitatively explains the form of the extension distribution. The model shows that the tail of the distribution at short extensions is determined by conformations with one hairpin. © 2018 Author(s).

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?