Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

PAN-cancer analysis of S-… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

PAN-cancer analysis of S-phase enriched lncRNAs identifies oncogenic drivers and biomarkers

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Moustafa Ali Mohamad
Vijay Suresh Akhade
Subazini Thankaswamy Kosalai
Santhilal Subhash
Luisa Statello
Meryet-Figuiere Matthieu
Jonas Abrahamsson
Tanmoy Mondal
Chandrasekhar Kanduri
Publicerad i Nature Communications
Volym 9
Nummer/häfte 1
ISSN 2041-1723
Publiceringsår 2018
Publicerad vid Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för pediatrik
Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi
Språk en
Länkar https://doi.org/s41467-018-03265-1
Ämnesord Cancer, lncRNAs, Cell cycle, TCGA
Ämneskategorier Cell- och molekylärbiologi

Sammanfattning

Despite improvement in our understanding of long noncoding RNAs (lncRNAs) role in cancer, efforts to find clinically relevant cancer-associated lncRNAs are still lacking. Here, using nascent RNA capture sequencing, we identify 1145 temporally expressed S-phase-enriched lncRNAs. Among these, 570 lncRNAs show significant differential expression in at least one tumor type across TCGA data sets. Systematic clinical investigation of 14 Pan-Cancer data sets identified 633 independent prognostic markers. Silencing of the top differentially expressed and clinically relevant S-phase-enriched lncRNAs in several cancer models affects crucial cancer cell hallmarks. Mechanistic investigations on SCAT7 in multiple cancer types reveal that it interacts with hnRNPK/YBX1 complex and affects cancer cell hallmarks through the regulation of FGF/FGFR and its downstream PI3K/AKT and MAPK pathways. We also implement a LNA-antisense oligo-based strategy to treat cancer cell line and patient-derived tumor (PDX) xenografts. Thus, this study provides a comprehensive list of lncRNA-based oncogenic drivers with potential prognostic value.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?