Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Transcriptomic Characteri… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Transcriptomic Characterization of the Human Cell Cycle in Individual Unsynchronized Cells.

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Joakim Karlsson
Thomas Kroneis
Emma Jonasson
Erik Larsson
Anders Ståhlberg
Publicerad i Journal of molecular biology
Volym 429
Nummer/häfte 24
Sidor 3909-3924
ISSN 1089-8638
Publiceringsår 2017
Publicerad vid Institutionen för biomedicin, avdelningen för patologi
Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi
Sidor 3909-3924
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.1016/j.jmb.2017.10.01...
www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.f...
Ämnesord Biomarkers, Tumor, genetics, Cell Cycle, genetics, Gene Expression Profiling, Humans, Liposarcoma, Myxoid, genetics, pathology, Mitosis, genetics, Single-Cell Analysis, methods, Transcriptome, Tumor Cells, Cultured
Ämneskategorier Cell- och molekylärbiologi

Sammanfattning

The highly fine-tuned dynamics of cell cycle gene expression have been intensely studied for several decades. However, some previous observations may be difficult to fully decouple from artifacts induced by traditional cell synchronization procedures. In addition, bulk cell measurements may have disguised intricate details. Here, we address this by sorting and transcriptomic sequencing of single cells progressing through the cell cycle without prior synchronization. Genes and pathways with known cell cycle roles are confirmed, associated regulatory sequence motifs are determined, and we also establish ties between other biological processes and the unsynchronized cell cycle. Importantly, we find the G1 phase to be surprisingly heterogeneous, with transcriptionally distinct early and late time points. We additionally note that mRNAs accumulate to reach maximum total levels at mitosis and find that stable transcripts show reduced cell-to-cell variability, consistent with the transcriptional burst model of gene expression. Our study provides the first detailed transcriptional profiling of an unsynchronized human cell cycle.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?