Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Bayesian Analysis of Micr… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Bayesian Analysis of MicroScale Thermophoresis Data to Quantify Affinity of Protein:Protein Interactions with Human Survivin.

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Maria-Jose Garcia-Bonete
Maja Jensen
Christian V Recktenwald
Sandra Rocha
Volker Stadler
Maria Bokarewa
Gergely Katona
Publicerad i Scientific reports
Volym 7
Nummer/häfte 1
Sidor 16816
ISSN 2045-2322
Publiceringsår 2017
Publicerad vid Institutionen för medicin, avdelningen för reumatologi och inflammationsforskning
Institutionen för kemi och molekylärbiologi
Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi
Sidor 16816
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.1038/s41598-017-17071...
www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.f...
Ämneskategorier Biokemi, Biofysik, Statistik, data- och systemvetenskap

Sammanfattning

A biomolecular ensemble exhibits different responses to a temperature gradient depending on its diffusion properties. MicroScale Thermophoresis technique exploits this effect and is becoming a popular technique for analyzing interactions of biomolecules in solution. When comparing affinities of related compounds, the reliability of the determined thermodynamic parameters often comes into question. The thermophoresis binding curves can be assessed by Bayesian inference, which provides a probability distribution for the dissociation constant of the interacting partners. By applying Bayesian machine learning principles, binding curves can be autonomously analyzed without manual intervention and without introducing subjective bias by outlier rejection. We demonstrate the Bayesian inference protocol on the known survivin:borealin interaction and on the putative protein-protein interactions between human survivin and two members of the human Shugoshin-like family (hSgol1 and hSgol2). These interactions were identified in a protein microarray binding assay against survivin and confirmed by MicroScale Thermophoresis.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?