Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Pan-cancer transcriptomic… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Pan-cancer transcriptomic analysis associates long non-coding RNAs with key mutational driver events

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Arghavan Ashouri
V. I. Sayin
Jimmy Van den Eynden
S. X. Singh
T. Papagiannakopoulos
Erik Larsson
Publicerad i Nature Communications
Volym 7
Sidor 13197
ISSN 2041-1723
Publiceringsår 2016
Publicerad vid Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi
Sidor 13197
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.1038/ncomms13197
Ämnesord cell lung-cancer, genomic analyses, gene-expression, messenger-rna, p53, reveals, nrf2, growth, proliferation, inactivation
Ämneskategorier Klinisk medicin, Cancer och onkologi

Sammanfattning

Thousands of long non-coding RNAs (lncRNAs) lie interspersed with coding genes across the genome, and a small subset has been implicated as downstream effectors in oncogenic pathways. Here we make use of transcriptome and exome sequencing data from thousands of tumours across 19 cancer types, to identify lncRNAs that are induced or repressed in relation to somatic mutations in key oncogenic driver genes. Our screen confirms known coding and non-coding effectors and also associates many new lncRNAs to relevant pathways. The associations are often highly reproducible across cancer types, and while many lncRNAs are co-expressed with their protein-coding hosts or neighbours, some are intergenic and independent. We highlight lncRNAs with possible functions downstream of the tumour suppressor TP53 and the master antioxidant transcription factor NFE2L2. Our study provides a comprehensive overview of lncRNA transcriptional alterations in relation to key driver mutational events in human cancers.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?