Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Quantitative Imaging of G… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Quantitative Imaging of Gut Microbiota Spatial Organization

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare K. A. Earle
G. Billings
M. Sigal
J. S. Lichtman
Gunnar C. Hansson
J. E. Elias
M. R. Amieva
K. C. Huang
J. L. Sonnenburg
Publicerad i Cell Host and Microbe
Volym 18
Nummer/häfte 4
Sidor 478-488
ISSN 1931-3128
Publiceringsår 2015
Publicerad vid Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi
Sidor 478-488
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.1016/j.chom.2015.09.0...
Ämneskategorier Mikrobiologi inom det medicinska området

Sammanfattning

Summary Genomic technologies have significantly advanced our understanding of the composition and diversity of host-associated microbial populations. However, their spatial organization and functional interactions relative to the host have been more challenging to study. Here we present a pipeline for the assessment of intestinal microbiota localization within immunofluorescence images of fixed gut cross-sections that includes a flexible software package, BacSpace, for high-throughput quantification of microbial organization. Applying this pipeline to gnotobiotic and human microbiota-colonized mice, we demonstrate that elimination of microbiota-accessible carbohydrates (MACs) from the diet results in thinner mucus in the distal colon, increased proximity of microbes to the epithelium, and heightened expression of the inflammatory marker REG3β. Measurements of microbe-microbe proximity reveal that a MAC-deficient diet alters monophyletic spatial clustering. Furthermore, we quantify the invasion of Helicobacter pylori into the glands of the mouse stomach relative to host mitotic progenitor cells, illustrating the generalizability of this approach. © 2015 Elsevier Inc.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?