Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

MEG3 long noncoding RNA r… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

MEG3 long noncoding RNA regulates the TGF-β pathway genes through formation of RNA–DNA triplex structures

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Tanmoy Mondal
Santhilal Subhash
Roshan Vaid
Stefan Enroth
Sireesha Uday
Björn Reinius
Sanhita Mitra
Arif Mohammed
Alva Rani James
Emily Hoberg
Aristidis Moustakas
Ulf Gyllensten
Steven J.M. Jones
Claes M Gustafsson
Andrew H Sims
Fredrik Westerlund
Eduardo Gorab
Chandrasekhar Kanduri
Publicerad i Nature Communications
Volym 6
Sidor art no. 7743
ISSN 2041-1723
Publiceringsår 2015
Publicerad vid Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk genetik och klinisk genetik
Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi
Sidor art no. 7743
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.1038/ncomms8743
https://gup.ub.gu.se/file/172114
Ämnesord 'Long non coding RNAs', 'MEG3', 'noncoding'
Ämneskategorier Molekylärbiologi, Medicinteknik, Medicinska grundvetenskaper, Medicinsk bioteknologi

Sammanfattning

Long noncoding RNAs (lncRNAs) regulate gene expression by association with chromatin, but how they target chromatin remains poorly understood. We have used chromatin RNA immunoprecipitation-coupled high-throughput sequencing to identify 276 lncRNAs enriched in repressive chromatin from breast cancer cells. Using one of the chromatin-interacting lncRNAs, MEG3, we explore the mechanisms by which lncRNAs target chromatin. Here we show that MEG3 and EZH2 share common target genes, including the TGF-β pathway genes. Genome-wide mapping of MEG3 binding sites reveals that MEG3 modulates the activity of TGF-β genes by binding to distal regulatory elements. MEG3 binding sites have GA-rich sequences, which guide MEG3 to the chromatin through RNA–DNA triplex formation. We have found that RNA–DNA triplex structures are widespread and are present over the MEG3 binding sites associated with the TGF-β pathway genes. Our findings suggest that RNA–DNA triplex formation could be a general characteristic of target gene recognition by the chromatin-interacting lncRNAs.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?