Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

SUPERSMART: ecology and e… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

SUPERSMART: ecology and evolution in the era of big data

Artikel i övriga tidskrifter
Författare Alexandre Antonelli
Fabien L. Condamine
Johannes Hettling
Karin Nilsson
R. Henrik Nilsson
Bengt Oxelman
Michael J Sanderson
Herve Sauquet
Ruud Scharn
Daniele Silvestro
Mats H. Töpel
Rutger A Vos
Publicerad i PeerJ PrePrints
ISSN 2167-9843
Publiceringsår 2014
Publicerad vid Institutionen för biologi och miljövetenskap
Språk en
Länkar https://peerj.com/preprints/501/
Ämnesord Phylogenetics, SUPERSMART
Ämneskategorier Biologisk systematik, Bioinformatik och systembiologi

Sammanfattning

Rapidly growing biological data volumes – including molecular sequences, species traits, geographic occurrences, specimen collections, and fossil records – hold an unprecedented, yet largely unexplored potential to reveal how ecological and evolutionary processes generate and maintain biodiversity. Most biodiversity studies integrating ecological data and evolutionary history use an idiosyncratic step-by-step approach for the reconstruction of time-calibrated phylogenies in light of ecological and evolutionary scenarios. Here we introduce a conceptual framework, termed SUPERSMART (Self-Updating Platform for Estimating Rates of Speciation and Migration, Ages, and Relationships of Taxa), and provide a proof of concept for dealing with the moving targets of biodiversity research. This framework reconstructs dated phylogenies based on the assembly of molecular datasets and collects pertinent data on ecology, distribution, and fossils of the focal clade. The data handled for each step are continuously updated as databases accumulate new records. We exemplify the practice of our method by presenting comprehensive phylogenetic and dating analyses for the orders Primates and the Gentianales. We believe that this emerging framework will provide an invaluable tool for a wide range of hypothesis-driven research questions in ecology and evolution.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?