Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

The landscape of viral ex… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

The landscape of viral expression and host gene fusion and adaptation in human cancer

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Ka-Wei Tang
Babak Alaei-Mahabadi
Tore Samuelsson
Magnus Lindh
Erik Larsson
Publicerad i Nature Communications
Volym 4
ISSN 2041-1723
Publiceringsår 2013
Publicerad vid Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi
Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.1038/ncomms3513
Ämnesord SQUAMOUS-CELL CARCINOMA, HUMAN-PAPILLOMAVIRUS, HEPATOCELLULAR-CARCINOMA, CERVICAL-CARCINOMA, INTEGRATION SITES, VIRUS, DNA, GENOME, HEAD, NECK, ENG JY, 1995, GUT, V37, P87
Ämneskategorier Klinisk medicin

Sammanfattning

Viruses cause 10-15% of all human cancers. Massively parallel sequencing has recently proved effective for uncovering novel viruses and virus-tumour associations, but this approach has not yet been applied to comprehensive patient cohorts. Here we screen a diverse landscape of human cancer, encompassing 4,433 tumours and 19 cancer types, for known and novel expressed viruses based on >700 billion transcriptome sequencing reads from The Cancer Genome Atlas Research Network. The resulting map confirms and extends current knowledge. We observe recurrent fusion events, including human papillomavirus insertions in RAD51B and ERBB2. Patterns of coadaptation between host and viral gene expression give clues to papillomavirus oncogene function. Importantly, our analysis argues strongly against viral aetiology in several cancers where this has frequently been proposed. We provide a virus-tumour map of unprecedented scale that constitutes a reference for future studies of tumour-associated viruses using transcriptome sequencing data.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?