Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Predicting Enzyme-Substra… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Predicting Enzyme-Substrate Specificity with QM/MM Methods: A Case Study of the Stereospecificity of D-Glucarate Dehydratase

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare B. X. Tian
F. Wallrapp
C. Kalyanaraman
S. W. Zhao
Leif A Eriksson
M. P. Jacobson
Publicerad i Biochemistry
Volym 52
Nummer/häfte 33
Sidor 5511-5513
ISSN 0006-2960
Publiceringsår 2013
Publicerad vid Institutionen för kemi och molekylärbiologi
Sidor 5511-5513
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.1021/bi400546j
Ämnesord MANDELATE RACEMASE ENZYME, D-GALACTONATE DEHYDRATASE, GENERAL ACID, CATALYST, ENOLASE SUPERFAMILY, ESCHERICHIA-COLI, ACTIVE-SITE, COMPUTER-SIMULATIONS, PSEUDOMONAS-PUTIDA, MOLECULAR-DYNAMICS, UNKNOWN, FUNCTION
Ämneskategorier Cell- och molekylärbiologi

Sammanfattning

The stereospecificity of D-glucarate dehydratase (GlucD) is explored by QM/MM calculations. Both the substrate binding and the chemical steps of GlucD contribute to substrate specificity. Although the identification of transition states remains computationally intensive, we suggest that QM/MM computations on ground states or intermediates can capture aspects of specificity that cannot be obtained using docking or molecular mechanics methods.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?