Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Strain-level typing and i… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Strain-level typing and identification of bacteria using mass spectrometry-based proteomics.

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Roger Karlsson
Max Davidson
Liselott Svensson-Stadler
Anders Karlsson
Kenneth Olesen
Elisabet Carlsohn
Edward R.B. Moore
Publicerad i Journal of proteome research
Volym 11
Nummer/häfte 5
Sidor 2710-20
ISSN 1535-3907
Publiceringsår 2012
Publicerad vid Institutionen för biomedicin
Institutionen för kemi och molekylärbiologi
Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar
Sidor 2710-20
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.1021/pr2010633
Ämnesord Amino Acid Sequence, Bacterial Proteins, analysis, chemistry, Bacterial Typing Techniques, methods, Cell Membrane, chemistry, Genome, Bacterial, Helicobacter pylori, chemistry, classification, genetics, Lipids, chemistry, Mass Spectrometry, methods, Membrane Proteins, analysis, chemistry, Molecular Sequence Data, Multilocus Sequence Typing, Peptide Fragments, analysis, chemistry, Phylogeny, Proteolysis, Proteomics, instrumentation, methods, Reproducibility of Results, Species Specificity
Ämneskategorier Klinisk medicin, Klinisk laboratoriemedicin

Sammanfattning

Because of the alarming expansion in the diversity and occurrence of bacteria displaying virulence and resistance to antimicrobial agents, it is increasingly important to be able to detect these microorganisms and to differentiate and identify closely related species, as well as different strains of a given species. In this study, a mass spectrometry proteomics approach is applied, exploiting lipid-based protein immobilization (LPI), wherein intact bacterial cells are bound, via membrane-gold interactions, within a FlowCell. The bound cells are subjected to enzymatic digestion for the generation of peptides, which are subsequently identified, using LC-MS. Following database matching, strain-specific peptides are used for subspecies-level discrimination. The method is shown to enable a reliable typing and identification of closely related strains of the same bacterial species, herein illustrated for Helicobacter pylori .

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?