Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Cis-regulation of microRN… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Cis-regulation of microRNA expression by scaffold/matrix-attachment regions

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Pavithra Lakshminarasimhan Chavali
Keiko Funa
Sreenivas Chavali
Publicerad i Nucleic Acids Research
Volym 39
Nummer/häfte 16
Sidor 6908-18
ISSN 0305-1048
Publiceringsår 2011
Publicerad vid Institutionen för biomedicin
Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi
Sidor 6908-18
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.1093/nar/gkr303
Ämnesord microRNA, scaffold/matrix-attachment regions, HMG I/Y,
Ämneskategorier Kemi

Sammanfattning

microRNAs (miRNAs) spatio-temporally modulate gene expression; however, very little is known about the regulation of their expression. Here, we hypothesized that the well-known cis-regulatory elements of gene expression, scaffold/matrix-attachment regions (MARs) could modulate miRNA expression. Accordingly, we found MARs to be enriched in the upstream regions of miRNA genes. To determine their role in cell type-specific expression of miRNAs, we examined four individual miRNAs (let-7b, miR-17, miR-93 and miR-221) and the miR-17-92 cluster, known to be overexpressed in neuroblastoma. Our results show that MARs indeed define the cell-specific expression of these miRNAs by tethering the chromatin to nuclear matrix. This is brought about by cell type-specific binding of HMG I/Y protein to MARs that then promotes the local acetylation of histones, serving as boundary elements for gene activation. The binding, chromatin tethering and gene activation by HMG I/Y was not observed in fibroblast control cells but were restricted to neuroblastoma cells. This study implies that the association of MAR binding proteins to MARs could dictate the tissue/context specific regulation of miRNA genes by serving as a boundary element signaling the transcriptional activation.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?