Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Kinship in the SRP RNA fa… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Kinship in the SRP RNA family

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Magnus Alm Rosenblad
Niels Larsen
Tore Samuelsson
Christian Zwieb
Publicerad i RNA Biology
Volym 6
Nummer/häfte 5
ISSN 1547-6286
Publiceringsår 2009
Publicerad vid Institutionen för cell- och molekylärbiologi
Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi
Språk en
Ämnesord Signal recognition particle, SRP, SRP RNA, comparative sequence anlysis
Ämneskategorier Molekylärbiologi, Bioinformatik och systembiologi, Funktionsgenomik

Sammanfattning

The signal recognition particle (SRP) is a ribonucleoprotein complex which participates in the targeting of protein to cellular membranes. The RNA component of the SRP has been found in all domains of life, but the size of the molecule and the number of RNA secondary structure elements vary considerably between the different phylogenetic groups. We continued our efforts to identify new SRP RNAs, compare their sequences, discover new secondary structure elements, conserved motifs, and other properties. We found additional proof for the variability in the apical loop of helix 8, and we identified several bacteria which lack all of their SRP components. Based on the distribution of SRP RNA features within the taxonomy, we suggest seven alignment groups: Bacteria with a small (4.5S) SRP RNA, Bacteria with a large (6S) SRP RNA, Archaea, Fungi (Ascomycota), Metazoa group, Protozoa group, and Plants. The proposed divisions improve the prediction of more distantly related SRP RNAs and provide a more inclusive representation of the SRP RNA family. Updates of the Rfam SRP RNA sequence collection are expected to benefit from the suggested groupings.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?