Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Expected Gene Order Dista… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Expected Gene Order Distances and Model Selection in Bacteria

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Daniel Dalevi
Niklas Eriksen
Publicerad i Bioinformatics
Volym 24
Nummer/häfte 11
Sidor 1332-1338
Publiceringsår 2008
Publicerad vid Institutionen för matematiska vetenskaper, matematik
Sidor 1332-1338
Språk en
Länkar bioinformatics.oxfordjournals.org/c...
Ämnesord reversal, inversion, transposition, gene order rearrangement, method of moments estimate
Ämneskategorier Diskret matematik, Teoretisk datalogi, Bioinformatik och systembiologi

Sammanfattning

Motivation: The evolutionary distance inferred from gene-order comparisons of related bacteria is dependent on the model. Therefore, it is highly important to establish reliable assumptions before inferring its magnitude. Results: We investigate the patterns of dotplots between species of bacteria with the purpose of model selection in gene-order problems. We find several categories of data which can be explained by carefully weighing the contributions of reversals, transpositions, symmetrical reversals, single gene transpositions and single gene reversals. We also derive method of moments distance estimates for some previously uncomputed cases, such as symmetrical reversals, single gene reversals and their combinations, as well as the single gene transpositions edit distance.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?