Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

The UNITE database for mo… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

The UNITE database for molecular identification of fungi: handling dark taxa and parallel taxonomic classifications.

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare R. Henrik Nilsson
Karl-Henrik Larsson
Andy F S Taylor
Johan Bengtsson-Palme
Thomas S Jeppesen
Dmitry Schigel
Peter Kennedy
Kathryn Picard
Frank Oliver Glöckner
Leho Tedersoo
Irja Saar
Urmas Kõljalg
Kessy Abarenkov
Publicerad i Nucleic acids research
Volym 47
Nummer/häfte D1
Sidor D259-D264
ISSN 1362-4962
Publiceringsår 2019
Publicerad vid Institutionen för biologi och miljövetenskap
CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning
Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar
Sidor D259-D264
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.1093/nar/gky1022
www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.f...
Ämneskategorier Mikrobiologi, Botanik, Genetik, Bioinformatik och systembiologi, Ekologi, Terrestrisk ekologi, Limnisk ekologi, Marin ekologi, Biologisk systematik, Funktionsgenomik, Lantbruksvetenskap, skogsbruk och fiske, Databaser, Databehandling, Bioinformatik (beräkningsbiologi)

Sammanfattning

UNITE (https://unite.ut.ee/) is a web-based database and sequence management environment for the molecular identification of fungi. It targets the formal fungal barcode-the nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region-and offers all ∼1 000 000 public fungal ITS sequences for reference. These are clustered into ∼459 000 species hypotheses and assigned digital object identifiers (DOIs) to promote unambiguous reference across studies. In-house and web-based third-party sequence curation and annotation have resulted in more than 275 000 improvements to the data over the past 15 years. UNITE serves as a data provider for a range of metabarcoding software pipelines and regularly exchanges data with all major fungal sequence databases and other community resources. Recent improvements include redesigned handling of unclassifiable species hypotheses, integration with the taxonomic backbone of the Global Biodiversity Information Facility, and support for an unlimited number of parallel taxonomic classification systems.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?