Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Preparation of Amplicon L… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Preparation of Amplicon Libraries for Metabarcoding of Marine Eukaryotes Using Illumina MiSeq: The Dual-PCR Method

Kapitel i bok
Författare Sarah Bourlat
Quiterie Haenel
Jennie Finnman
Matthieu Leray
Publicerad i Marine Genomics: Methods and Protocols
Sidor 197-207
ISBN 978-1-4939-3772-1
Förlag Springer
Förlagsort New York
Publiceringsår 2016
Publicerad vid Institutionen för marina vetenskaper
Core Facilities, Genomics
Sidor 197-207
Språk en
Ämnesord Metabarcoding Biodiversity Microscopic eukaryotes Illumina MiSeq
Ämneskategorier Biokemi och molekylärbiologi, Genetik

Sammanfattning

This protocol details the preparation of multiplexed amplicon libraries for metabarcoding (amplicon-based) studies of microscopic marine eukaryotes. Metabarcoding studies, based on the amplification of a taxonomically informative marker from a collection of organisms or an environmental sample, can be performed to analyze biodiversity patterns or predator–prey interactions. For Metazoa, we use the mitochondrial cytochrome oxidase 1 (CO1) or the small ribosomal subunit (SSU) markers. Here, we describe a strategy for the preparation of multiplexed Illumina MiSeq libraries using a dual-PCR approach for the addition of index and adaptor sequences.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?