Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

FARAO: the flexible all-r… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

FARAO: the flexible all-round annotation organizer

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Rickard Hammarén
Chandan Pal
Johan Bengtsson-Palme
Publicerad i Bioinformatics
Volym 32
Nummer/häfte 23
Sidor 3664-3666
ISSN 1367-4803
Publiceringsår 2016
Publicerad vid CARe - Centrum för antibiotikaresistensforskning
Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar
Sidor 3664-3666
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/b...
Ämnesord Annotation, Genomics, Metagenomics, Visualization
Ämneskategorier Funktionsgenomik, Bioinformatik och systembiologi, Bioinformatik (beräkningsbiologi)

Sammanfattning

Summary: With decreasing costs of generating DNA sequence data, genome and metagenome projects have become accessible to a wider scientific community. However, to extract meaningful information and visualize the data remain challenging. We here introduce FARAO, a highly scalable software for organization, visualization and integration of annotation and read coverage data that can also combine output data from several bioinformatics tools. The capabilities of FARAO can greatly aid analyses of genomic and metagenomic datasets. Availability and Implementation: FARAO is implemented in Perl and is supported under Unix-like operative systems, including Linux and macOS. The Perl source code is freely available for download under the MIT License from http://microbiology.se/software/farao/.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?