Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Detection of signal recog… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Detection of signal recognition particle (SRP) RNAs in the nuclear ribosomal internal transcribed spacer 1 (ITS1) of three lineages of ectomycorrhizal fungi (Agaricomycetes, Basidiomycota)

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Magnus Alm Rosenblad
María P. Martín
Leho Tedersoo
Martin K. Ryberg
Ellen Larsson
Christian Wurzbacher
Kessy Abarenkov
R. Henrik Nilsson
Publicerad i MycoKeys
Volym 13
Sidor 21-33
ISSN 1314-4057
Publiceringsår 2016
Publicerad vid Institutionen för marina vetenskaper
Institutionen för biologi och miljövetenskap
Sidor 21-33
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.3897/mycokeys.13.8579
https://gup.ub.gu.se/file/192119
Ämnesord SRP RNA, non-coding RNA, ribosomal RNA, internal transcribed spacer 1 (ITS1), ectomycorrhizal fungi
Ämneskategorier Strukturbiologi, Biokemi och molekylärbiologi, Botanik, Genetik, Bioinformatik och systembiologi, Biologisk systematik, Evolutionsbiologi, Funktionsgenomik

Sammanfattning

During a routine scan for Signal Recognition Particle (SRP) RNAs in eukaryotic sequences, we surprisingly found in silico evidence in GenBank for a 265-base long SRP RNA sequence in the ITS1 region of a total of 11 fully identified species in three ectomycorrhizal genera of the Basidiomycota (Fungi): Astraeus, Russula, and Lactarius. To rule out sequence artifacts, one specimen from a species indicated to have the SRP RNA-containing ITS region in each of these genera was ordered and re-sequenced. Sequences identical to the corresponding GenBank entries were recovered, or in the case of a non-original but conspecific specimen differed by three bases, showing that these species indeed have an SRP RNA sequence incorporated into their ITS1 region. Other than the ribosomal genes, this is the first known case of non-coding RNAs in the eukaryotic ITS region, and it may assist in the examination of other types of insertions in fungal genomes.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?