Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Extension of nanoconfined… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Extension of nanoconfined DNA: quantitative comparison between experiment and theory

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Vitalii Iarko
Erik Werner
Lena Nyberg
Vilhelm Müller
Joachim Fritzsche
T. Amjörnsson
J. P. Beech
Jonas O. Tegenfeldt
Kirsten Mehlig
Fredrik Westerlund
Bernhard Mehlig
Publicerad i Physical Review E. Statistical, Nonlinear, and Soft Matter Physics
Volym 92
Nummer/häfte 6
Sidor Art. Nr. 062701
ISSN 1539-3755
Publiceringsår 2015
Publicerad vid Institutionen för medicin, avdelningen för samhällsmedicin och folkhälsa, enheten för folkhälsoepidemiologi
Institutionen för fysik (GU)
Sidor Art. Nr. 062701
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.1103/PhysRevE.92.0627...
https://gup.ub.gu.se/file/205545
Ämneskategorier Fysik

Sammanfattning

The extension of DNA confined to nanochannels has been studied intensively and in detail. Yet quantitative comparisons between experiments and model calculations are difficult because most theoretical predictions involve undetermined prefactors, and because the model parameters (contour length, Kuhn length, effective width) are difficult to compute reliably, leading to substantial uncertainties. Here we use a recent asymptotically exact theory for the DNA extension in the "extended de Gennes regime" that allows us to compare experimental results with theory. For this purpose we performed new experiments, measuring the mean DNA extension and its standard deviation while varying the channel geometry, dye intercalation ratio, and ionic buffer strength. The experimental results agree very well with theory at high ionic strengths, indicating that the model parameters are reliable. At low ionic strengths the agreement is less good. We discuss possible reasons. Our approach allows, in principle, to measure the Kuhn length and effective width of a single DNA molecule and more generally of semiflexible polymers in solution.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?