Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Response to Comment on “G… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Response to Comment on “Global diversity and geography of soil fungi”

Artikel i övriga tidskrifter
Författare Leho Tedersoo
Mohammad Bahram
Sergei Põlme
Sten Anslan
Taavi Riit
Urmas Kõljalg
R. Henrik Nilsson
Falk Hildebrand
Kessy Abarenkov
Publicerad i Science
Volym 349
Nummer/häfte 6251
Sidor 936
ISSN 0036-8075
Publiceringsår 2015
Publicerad vid Institutionen för biologi och miljövetenskap
Sidor 936
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.1126/science.aaa5594
Ämnesord Fungi ; biodiversity ; PCR ; sequencing ; primers ; metabarcoding ; metagenomics
Ämneskategorier Databaser, Bioinformatik (beräkningsbiologi), Botanik, Bioinformatik och systembiologi, Terrestrisk ekologi, Biologisk systematik, Evolutionsbiologi, Medicinsk mikrobiologi, Markvetenskap, Markbiologi

Sammanfattning

Schadt and Rosling (Technical Comment, 26 June 2015, p. 1438) argue that primer-template mismatches neglected the fungal class Archaeorhizomycetes in a global soil survey. Amplicon-based metabarcoding of nine barcode-primer pair combinations and polymerase chain reaction (PCR)–free shotgun metagenomics revealed that barcode and primer choice and PCR bias drive the diversity and composition of microorganisms in general, but the Archaeorhizomycetes were little affected in the global study. We urge that careful choice of DNA markers and primers is essential for ecological studies using high-throughput sequencing for identification.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?