Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Standardizing metadata an… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Standardizing metadata and taxonomic identification in metabarcoding studies

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Leho Tedersoo
Kelly S. Ramirez
R. Henrik Nilsson
Aivi Kaljuvee
Urmas Kõljalg
Kessy Abarenkov
Publicerad i GigaScience
Volym 4
Sidor artikel nr 34
ISSN 2047-217X
Publiceringsår 2015
Publicerad vid Institutionen för biologi och miljövetenskap
Sidor artikel nr 34
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.1186/s13742-015-0074-...
Ämnesord High-throughput sequencing (HTS); Next-generation sequencing; Data storage; Environmental metadata; Species hypotheses; Digital object identifiers (DOI); Internal transcribed spacer (ITS); Interactive database
Ämneskategorier Databaser, Bioinformatik (beräkningsbiologi), Mikrobiologi, Botanik, Bioinformatik och systembiologi, Terrestrisk ekologi, Biologisk systematik, Mikrobiologi inom det medicinska området, Skogsvetenskap, Markbiologi

Sammanfattning

High-throughput sequencing-based metabarcoding studies produce vast amounts of ecological data, but a lack of consensus on standardization of metadata and how to refer to the species recovered severely hampers reanalysis and comparisons among studies. Here we propose an automated workflow covering data submission, compression, storage and public access to allow easy data retrieval and inter-study communication. Such standardized and readily accessible datasets facilitate data management, taxonomic comparisons and compilation of global metastudies.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?