Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Preparation of Amplicon L… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Preparation of Amplicon Libraries for Metabarcoding of Marine Eukaryotes Using Illumina MiSeq: The Dual-PCR Method

Kapitel i bok
Författare Sarah Bourlat
Quiterie Haenel
Jennie Finnman
Matthieu Leray
Publicerad i Marine Genomics: Methods and Protocols
Sidor 197-207
ISBN 978-1-4939-3772-1
Förlag Springer
Förlagsort New York
Publiceringsår 2016
Publicerad vid Institutionen för marina vetenskaper
Core Facilities, Genomics
Sidor 197-207
Språk en
Ämnesord Metabarcoding Biodiversity Microscopic eukaryotes Illumina MiSeq
Ämneskategorier Biokemi och molekylärbiologi, Genetik

Sammanfattning

This protocol details the preparation of multiplexed amplicon libraries for metabarcoding (amplicon-based) studies of microscopic marine eukaryotes. Metabarcoding studies, based on the amplification of a taxonomically informative marker from a collection of organisms or an environmental sample, can be performed to analyze biodiversity patterns or predator–prey interactions. For Metazoa, we use the mitochondrial cytochrome oxidase 1 (CO1) or the small ribosomal subunit (SSU) markers. Here, we describe a strategy for the preparation of multiplexed Illumina MiSeq libraries using a dual-PCR approach for the addition of index and adaptor sequences.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?

Denna text är utskriven från följande webbsida:
http://www.gu.se/forskning/publikation/?publicationId=240556
Utskriftsdatum: 2019-11-20