Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Efficient prediction of h… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Efficient prediction of human protein-protein interactions at a global scale

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare A. Schoenrock
B. Samanfar
S. Pitre
M. Hooshyar
K. Jin
C. A. Phillips
Hui Wang
S. Phanse
K. Omidi
Y. Gui
M. Alamgir
A. Wong
Fredrik Barrenäs
M. Babu
Mikael Benson
M. A. Langston
J. R. Green
F. Dehne
A. Golshani
Publicerad i Bmc Bioinformatics
Volym 15
Sidor Article nr. 383
ISSN 1471-2105
Publiceringsår 2014
Publicerad vid Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för pediatrik
Sidor Article nr. 383
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.1186/s12859-014-0383-...
Ämnesord Protein-protein interactions, Computational prediction, Human proteome, Massively parallel, YEAST SACCHAROMYCES-CEREVISIAE, SHORT POLYPEPTIDE SEQUENCES, INTERACTION, NETWORKS, ALLERGIC RHINITIS, DNA-DAMAGE, COMPUTATIONAL METHODS, MESSENGER-RNA, BREAST-CANCER, AURORA B, DISEASE, Biochemical Research Methods, Biotechnology & Applied Microbiology, Mathematical & Computational Biology
Ämneskategorier Molekylärbiologi

Sammanfattning

Background: Our knowledge of global protein-protein interaction (PPI) networks in complex organisms such as humans is hindered by technical limitations of current methods. Results: On the basis of short co-occurring polypeptide regions, we developed a tool called MP-PIPE capable of predicting a global human PPI network within 3 months. With a recall of 23% at a precision of 82.1%, we predicted 172,132 putative PPIs. We demonstrate the usefulness of these predictions through a range of experiments. Conclusions: The speed and accuracy associated with MP-PIPE can make this a potential tool to study individual human PPI networks (from genomic sequences alone) for personalized medicine.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?