Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Mycobiome diversity: high… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Kontaktformulär








 


OBS! Vill du ha svar, ange e-post eller telefonnummer!




Mycobiome diversity: high-throughput sequencing and identification of fungi.

Forskningsöversiktsartikel
Författare R. Henrik Nilsson
Sten Anslan
Mohammad Bahram
Christian Wurzbacher
Petr Baldrian
Leho Tedersoo
Publicerad i Nature reviews. Microbiology
Volym 17
Sidor 95-109
ISSN 1740-1534
Publiceringsår 2019
Publicerad vid Institutionen för biologi och miljövetenskap
Sidor 95-109
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.1038/s41579-018-0116-...
www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.f...
Ämnesord Fungi ; ecology ; nutrient cycling ; climate change ; systematics ; high-throughput sequencing ; review
Ämneskategorier Nanoteknik, Lantbruksvetenskap, skogsbruk och fiske, Veterinärmedicin, Programvaruteknik, Databaser, Databehandling, Bioinformatik (beräkningsbiologi), Klimatforskning, Miljövetenskap, Oceanografi, Mikrobiologi, Botanik, Zoologi, Bioinformatik och systembiologi, Genetik, Ekologi, Biologisk systematik, Terrestrisk ekologi, Limnisk ekologi, Marin ekologi, Evolutionsbiologi, Funktionsgenomik, Medicinsk mikrobiologi

Sammanfattning

Fungi are major ecological players in both terrestrial and aquatic environments by cycling organic matter and channelling nutrients across trophic levels. High-throughput sequencing (HTS) studies of fungal communities are redrawing the map of the fungal kingdom by hinting at its enormous - and largely uncharted - taxonomic and functional diversity. However, HTS approaches come with a range of pitfalls and potential biases, cautioning against unwary application and interpretation of HTS technologies and results. In this Review, we provide an overview and practical recommendations for aspects of HTS studies ranging from sampling and laboratory practices to data processing and analysis. We also discuss upcoming trends and techniques in the field and summarize recent and noteworthy results from HTS studies targeting fungal communities and guilds. Our Review highlights the need for reproducibility and public data availability in the study of fungal communities. If the associated challenges and conceptual barriers are overcome, HTS offers immense possibilities in mycology and elsewhere.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?