Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Defining cell populations… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Kontaktformulär








 


OBS! Vill du ha svar, ange e-post eller telefonnummer!




Defining cell populations with single-cell gene expression profiling: correlations and identification of astrocyte subpopulations.

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Anders Ståhlberg
Daniel Andersson
Johan Aurelius
Maryam Faiz
Marcela Pekna
Mikael Kubista
Milos Pekny
Publicerad i Nucleic acids research
Volym 39
Nummer/häfte 4
Sidor e24
ISSN 1362-4962
Publiceringsår 2011
Publicerad vid Institutionen för neurovetenskap och fysiologi, sektionen för klinisk neurovetenskap och rehabilitering
Institutionen för biomedicin, avdelningen för medicinsk kemi och cellbiologi
Institutionen för biomedicin, avdelningen för infektionssjukdomar
Sidor e24
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.1093/nar/gkq1182
Ämnesord Animals, Astrocytes, classification, metabolism, Cells, Cultured, Gene Expression, Gene Expression Profiling, methods, Mice, RNA, Messenger, analysis, Single-Cell Analysis, Stem Cells, metabolism, Up-Regulation
Ämneskategorier Medicin och Hälsovetenskap

Sammanfattning

Single-cell gene expression levels show substantial variations among cells in seemingly homogenous populations. Astrocytes perform many control and regulatory functions in the central nervous system. In contrast to neurons, we have limited knowledge about functional diversity of astrocytes and its molecular basis. To study astrocyte heterogeneity and stem/progenitor cell properties of astrocytes, we used single-cell gene expression profiling in primary mouse astrocytes and dissociated mouse neurosphere cells. The transcript number variability for astrocytes showed lognormal features and revealed that cells in primary cultures to a large extent co-express markers of astrocytes and neural stem/progenitor cells. We show how subpopulations of cells can be identified at single-cell level using unsupervised algorithms and that gene correlations can be used to identify differences in activity of important transcriptional pathways. We identified two subpopulations of astrocytes with distinct gene expression profiles. One had an expression profile very similar to that of neurosphere cells, whereas the other showed characteristics of activated astrocytes in vivo.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?