Till sidans topp

Sidansvarig: Webbredaktion
Sidan uppdaterades: 2012-09-11 15:12

Tipsa en vän
Utskriftsversion

Synthesis, oligonucleotid… - Göteborgs universitet Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Kontaktformulär








 


OBS! Vill du ha svar, ange e-post eller telefonnummer!




Synthesis, oligonucleotide incorporation and fluorescence properties in DNA of a bicyclic thymine analogue

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Christopher P. Lawson
A. F. Fuchtbauer
M. S. Wranne
T. Giraud
T. Floyd
B. Dumat
N. K. Andersen
A. H. El-Sagheer
T. Brown
H. Graden
L. M. Wilhelmsson
Morten Grötli
Publicerad i Scientific Reports
Volym 8
ISSN 2045-2322
Publiceringsår 2018
Publicerad vid Institutionen för kemi och molekylärbiologi
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.1038/s41598-018-31897...
Ämnesord base analog, nucleic-acids, quadracyclic adenine, circular-dichroism, helix formation, 2-aminopurine, probe, rna, 1,8-naphthyridin-2(1h)-ones, thermodynamics
Ämneskategorier Organisk kemi

Sammanfattning

Fluorescent base analogues (FBAs) have emerged as a powerful class of molecular reporters of location and environment for nucleic acids. In our overall mission to develop bright and useful FBAs for all natural nucleobases, herein we describe the synthesis and thorough characterization of bicyclic thymidine (bT), both as a monomer and when incorporated into DNA. We have developed a robust synthetic route for the preparation of the bT DNA monomer and the corresponding protected phosphoramidite for solid-phase DNA synthesis. The bT deoxyribonucleoside has a brightness value of 790 M(-1)cm(-1) in water, which is comparable or higher than most fluorescent thymine analogues reported. When incorporated into DNA, bT pairs selectively with adenine without perturbing the B-form structure, keeping the melting thermodynamics of the B-form duplex DNA virtually unchanged. As for most fluorescent base analogues, the emission of bT is reduced inside DNA (4.5- and 13-fold in single- and double-stranded DNA, respectively). Overall, these properties make bT an interesting thymine analogue for studying DNA and an excellent starting point for the development of brighter bT derivatives.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?