Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

NGS-based biodiversity and community structure analysis of meiofaunal eukaryotes in shell sand from Hållö island, Smögen, and soft mud from Gullmarn Fjord, Sweden

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Quiterie Haenel
Oleksandr Holovachov
Ulf Jondelius
Per Sundberg
Sarah Bourlat
Publicerad i Biodiversity Data Journal
Volym 5
Publiceringsår 2017
Publicerad vid Institutionen för marina vetenskaper
Språk en
Länkar https://doi.org/10.3897/BDJ.5.e1273...
Ämnesord 18S, COI, Community structure, Illumina Mi-Seq, Meiofaunal biodiversity, Metabarcoding
Ämneskategorier Genetik, Zoologi, Biologisk systematik, Bioinformatik och systembiologi

Sammanfattning

© Haenel Q et al. Aim: The aim of this study was to assess the biodiversity and community structure of Swedish meiofaunal eukaryotes using metabarcoding. To validate the reliability of the metabarcoding approach, we compare the taxonomic resolution obtained using the mitochondrial cytochrome oxidase 1 (COI) 'mini-barcode' and nuclear 18S small ribosomal subunit (18S) V1-V2 region, with traditional morphology-based identification of Xenacoelomorpha and Nematoda. Location: 30 samples were analysed from two ecologically distinct locations along the west coast of Sweden. 18 replicate samples of coarse shell sand were collected along the northeastern side of Hållö island near Smögen, while 12 replicate samples of soft mud were collected in the Gullmarn Fjord near Lysekil.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?