Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Contrasting evolutionary genome dynamics between domesticated and wild yeasts

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare J. X. Yue
J. Li
L. Aigrain
J. Hallin
Karl O. Persson
K. Oliver
A. Bergstrom
P. Coupland
Jonas Warringer
M. C. Lagomarsino
G. Fischer
R. Durbin
G. Liti
Publicerad i Nature Genetics
Volym 49
Nummer/häfte 6
Sidor 913-+
ISSN 1061-4036
Publiceringsår 2017
Publicerad vid Institutionen för kemi och molekylärbiologi
Sidor 913-+
Språk English
Länkar doi.org/10.1038/ng.3847
Ämnesord genetic reference panel, sensu-stricto complex, saccharomyces-cerevisiae, chromosomal rearrangements, phylogenetic, analysis, human subtelomeres, natural variation, candida-albicans, sequencing data, high-throughput, Genetics & Heredity
Ämneskategorier Genetik

Sammanfattning

Structural rearrangements have long been recognized as an important source of genetic variation, with implications in phenotypic diversity and disease, yet their detailed evolutionary dynamics remain elusive. Here we use long-read sequencing to generate end-to-end genome assemblies for 12 strains representing major subpopulations of the partially domesticated yeast Saccharomyces cerevisiae and its wild relative Saccharomyces paradoxus. These population-level high-quality genomes with comprehensive annotation enable precise definition of chromosomal boundaries between cores and subtelomeres and a high-resolution view of evolutionary genome dynamics. In chromosomal cores, S. paradoxus shows faster accumulation of balanced rearrangements (inversions, reciprocal translocations and transpositions), whereas S. cerevisiae accumulates unbalanced rearrangements (novel insertions, deletions and duplications) more rapidly. In subtelomeres, both species show extensive interchromosomal reshuffling, with a higher tempo in S. cerevisiae. Such striking contrasts between wild and domesticated yeasts are likely to reflect the influence of human activities on structural genome evolution.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?