Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Novel soil-inhabiting clades fill gaps in the fungal tree of life

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare Leho Tedersoo
Mohammad Bahram
Rasmus Puusepp
R. Henrik Nilsson
Timothy Y. James
Publicerad i Microbiome
Volym 5
Publiceringsår 2017
Publicerad vid Institutionen för biologi och miljövetenskap
Språk en
Länkar https://doi.org/10.1186/s40168-017-...
https://gup-server.ub.gu.se/v1/asse...
Ämnesord Phylogenetic lineages ; Kingdom Fungi ; Niche modelling ; Random forest ; Biogeography
Ämneskategorier Skogsvetenskap, Markvetenskap, Jordbruksvetenskap, Klimatforskning, Biologiska vetenskaper, Biokemi och molekylärbiologi, Mikrobiologi, Botanik, Bioinformatik och systembiologi, Biologisk systematik, Evolutionsbiologi, Bioinformatik (beräkningsbiologi)

Sammanfattning

Background - Fungi are a diverse eukaryotic group of degraders, pathogens, and symbionts, with many lineages known only from DNA sequences in soil, sediments, air, and water. Results - We provide rough phylogenetic placement and principal niche analysis for >40 previously unrecognized fungal groups at the order and class level from global soil samples based on combined 18S (nSSU) and 28S (nLSU) rRNA gene sequences. Especially, Rozellomycota (Cryptomycota), Zygomycota s.lat, Ascomycota, and Basidiomycota are rich in novel fungal lineages, most of which exhibit distinct preferences for climate and soil pH. Conclusions - This study uncovers the great phylogenetic richness of previously unrecognized order- to phylum-level fungal lineages. Most of these rare groups are distributed in different ecosystems of the world but exhibit distinct ecological preferences for climate or soil pH. Across the fungal kingdom, tropical and non-tropical habitats are equally likely to harbor novel groups. We advocate that a combination of traditional and high-throughput sequencing methods enable efficient recovery and phylogenetic placement of such unknown taxonomic groups.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?