Till startsida
Webbkarta
Till innehåll Läs mer om hur kakor används på gu.se

Top 50 most wanted fungi

Artikel i vetenskaplig tidskrift
Författare R. Henrik Nilsson
Christian Wurzbacher
Mohammad Bahram
Victor R. M. Coimbra
Ellen Larsson
Leho Tedersoo
Jonna S. Eriksson
Camila Duarte
Sten Svantesson
Marisol Sánchez-García
Martin Ryberg
Erik Kristiansson
Kessy Abarenkov
Publicerad i MycoKeys
Volym 12
Sidor 29-40
ISSN 1314-4057
Publiceringsår 2016
Publicerad vid Institutionen för matematiska vetenskaper, Tillämpad matematik och statistik
Institutionen för biologi och miljövetenskap
Sidor 29-40
Språk en
Länkar dx.doi.org/10.3897/mycokeys.12.7553
https://gup-server.ub.gu.se/v1/asse...
Ämnesord Fungi, environmental sequencing, taxonomic orphans, metabarcoding, taxonomy feedback loop
Ämneskategorier Bioinformatik (beräkningsbiologi), Biologiska vetenskaper, Mikrobiologi, Botanik, Bioinformatik och systembiologi, Biologisk systematik, Jordbruksvetenskap, Skogsvetenskap, Markbiologi, Mikrobiologi och immunologi

Sammanfattning

Environmental sequencing regularly recovers fungi that cannot be classified to any meaningful taxonomic level beyond “Fungi”. There are several examples where evidence of such lineages has been sitting in public sequence databases for up to ten years before receiving scientific attention and formal recognition. In order to highlight these unidentified lineages for taxonomic scrutiny, a search function is presented that produces updated lists of approximately genus-level clusters of fungal ITS sequences that remain unidentified at the phylum, class, and order levels, respectively. The search function (https://unite.ut.ee/top50.php) is implemented in the UNITE database for molecular identification of fungi, such that the underlying sequences and fungal lineages are open to third-party annotation. We invite researchers to examine these enigmatic fungal lineages in the hope that their taxonomic resolution will not have to wait another ten years or more.

Sidansvarig: Webbredaktion|Sidan uppdaterades: 2012-09-11
Dela:

På Göteborgs universitet använder vi kakor (cookies) för att webbplatsen ska fungera på ett bra sätt för dig. Genom att surfa vidare godkänner du att vi använder kakor.  Vad är kakor?